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CPHI制藥在線 資訊 Scripps研究所的獨(dú)行者促使制藥界巨頭投資靶向RNA的小分子藥物

Scripps研究所的獨(dú)行者促使制藥界巨頭投資靶向RNA的小分子藥物

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作者:陳斌  來(lái)源:CPhI制藥在線
  2018-01-08
業(yè)界越來(lái)越多的公司開(kāi)始考慮回到開(kāi)發(fā)靶向RNA小分子藥物領(lǐng)域,目前進(jìn)入該領(lǐng)域的A輪風(fēng)頭資金已經(jīng)達(dá)到5500萬(wàn)美元,因Matthew Disney教授的推動(dòng),他們正在重新回到考慮在松散的RNA架構(gòu)上設(shè)計(jì)特異性靶向分子。

       近年來(lái)生物類(lèi)抗體藥進(jìn)入市場(chǎng)的黃金時(shí)期,EvaluatePhrama評(píng)估2018年預(yù)估銷(xiāo)售TOP10藥物榜單中我們發(fā)現(xiàn),以艾伯維公司修美樂(lè)為首的抗體藥物占據(jù)前十的銷(xiāo)售額排名的八席。

數(shù)據(jù)來(lái)源于EvaluatePhrama

       數(shù)據(jù)來(lái)源于EvaluatePhrama

       一時(shí)之間全球媒體和資本投資機(jī)構(gòu)都高度關(guān)注生物抗體領(lǐng)域?yàn)槿祟?lèi)健康帶來(lái)革命性進(jìn)步,抗體藥物可以比小分子藥物更有可能的治療好目前醫(yī)學(xué)史上的疑難雜癥。

       北卡大學(xué)專(zhuān)注于RNA領(lǐng)域研究的Kevin M Weeks教授卻談道:"民眾、媒體與資本都認(rèn)為人類(lèi)健康的未來(lái)在于基因生物技術(shù),近年大量的熱錢(qián)涌入了基因生物領(lǐng)域。但事實(shí)上這只是人類(lèi)踏入基因技術(shù)的一小步,在我一直從事的RNA研究領(lǐng)域中,我們發(fā)現(xiàn)有很多小分子藥物也可以參與到了調(diào)節(jié)人類(lèi)細(xì)胞的過(guò)程中。"

       RNA領(lǐng)域研究的回顧

       事實(shí)上20世紀(jì)90年代到21世紀(jì)初全球的研發(fā)團(tuán)隊(duì)進(jìn)行過(guò)不少的病毒RNA與小分子藥物之間相互作用的研究,但是大多數(shù)項(xiàng)目都因投資金額與回報(bào)不成比例或大型制藥公司的研究重點(diǎn)的改變而夭折。

       Kevin M Week教授回憶道:"要知道在那個(gè)年代,RNA領(lǐng)域的基礎(chǔ)研究本質(zhì)上是一個(gè)非??膳碌哪繕?biāo),當(dāng)時(shí)所有的投資人并不知道何時(shí)可以看到回報(bào),何時(shí)是這類(lèi)項(xiàng)目的終點(diǎn)。"

       "很多早期的研究項(xiàng)目小分子化合物都是在非常簡(jiǎn)化與優(yōu)化后的條件下進(jìn)行測(cè)試的。一旦進(jìn)入了類(lèi)人類(lèi)的仿生系統(tǒng)時(shí),它們就不能如預(yù)期設(shè)定的那樣很好的工作,這消耗了絕大多數(shù)投資者的熱情。"

       聯(lián)合創(chuàng)立了一家現(xiàn)已解散的公司Ribo Targets的創(chuàng)始人之一Garbriele Varani教授也談道:"實(shí)際上我們公司當(dāng)初的研究發(fā)現(xiàn),能找到與RNA結(jié)合的藥物分子并不難,難點(diǎn)在于找到特定點(diǎn)位與結(jié)構(gòu)松散的RNA結(jié)合的藥物分子。"

       目前Garbriele Varani教授在公司的解散后又重新回到了華盛頓大學(xué)進(jìn)行蛋白與RNA相互作用相關(guān)的基礎(chǔ)研究。

       "RNA帶著強(qiáng)烈的負(fù)電荷,這意味著帶正電荷的藥物分子會(huì)一次性粘附多個(gè)RNA,這種不分青紅皂白的結(jié)合方式往往帶來(lái)災(zāi)難性的副作用和**,已知的氨基糖苷類(lèi)抗生素便是如此,以至于我們只能把這些結(jié)合體歸類(lèi)為(混雜的分子)"。Garbriele Varani教授談道"所以調(diào)節(jié)病毒RNA為靶標(biāo)創(chuàng)造藥物尚且困難,對(duì)以人體RNA為靶標(biāo)這將是一個(gè)挑戰(zhàn)性更高的課題。"

上圖為:默克公司保留的核糖核酸化合物與細(xì)菌核黃素核糖RNA結(jié)合的模型

       上圖為:默克公司保留的核糖核酸化合物與細(xì)菌核黃素核糖RNA結(jié)合的模型

       但美國(guó)殿堂級(jí)的Scripps研究所里有一位牛人不這么想,這位"獨(dú)行者"是Matthew Disney教授。他已經(jīng)從事小分子藥物靶向人類(lèi)RNA領(lǐng)域的研究長(zhǎng)達(dá)12年,直至今日Disney教授終于在次鄰域的黑暗中撥開(kāi)了一縷陽(yáng)光。

自帶“唇印”的“獨(dú)行者”Matthew Disney教授   照片來(lái)源于Scripps研究所主頁(yè)

       自帶"唇印"的"獨(dú)行者"Matthew Disney教授 照片來(lái)源于Scripps研究所主頁(yè)

       在美國(guó)化工協(xié)會(huì)的采訪中Matthew Disney教授談道:"我這12年來(lái)都是在痛苦與沉默中度過(guò)的,學(xué)術(shù)同行們都知道我的學(xué)術(shù)課題風(fēng)險(xiǎn)性太大,我大多數(shù)的工作內(nèi)容都是在進(jìn)行各種包括對(duì)于自身所學(xué)的懷疑,我知道有同行對(duì)我的言論幾乎不屑一顧。

       (這也是作者為何將Disney教授稱(chēng)呼為"獨(dú)行者"的原因)

       艱難的時(shí)光中聯(lián)邦政府甚至不愿意繼續(xù)為我的這些項(xiàng)目提供科研資金,業(yè)界的朋友們都說(shuō)根本沒(méi)有足夠的數(shù)據(jù)以及理論支持我可以完成靶向人類(lèi)RNA的小分子藥物的設(shè)計(jì)。"

       "但我的研究數(shù)據(jù)告訴我,人們?nèi)粘7玫拿恳粋€(gè)藥片都是為了改變蛋白的活性。這是因?yàn)檫@些蛋白通常在細(xì)胞中扮演著信使或構(gòu)建者的角色。為了達(dá)到目的,蛋白在復(fù)雜的三維結(jié)構(gòu)中使用'靶點(diǎn)口袋'來(lái)構(gòu)建或分解分子。而藥物設(shè)計(jì)者通過(guò)創(chuàng)造適合內(nèi)部的小分子藥物來(lái)阻斷或調(diào)節(jié)蛋白活性達(dá)到成藥目的。"

       "另一方面,RNA是制造蛋白的指令集,在教科書(shū)插圖中RNA由四個(gè)核苷酸構(gòu)建成,因此它們看上去更類(lèi)似于一個(gè)由20個(gè)氨基酸組成的蛋白。這樣的難度使得20世紀(jì)時(shí)的科研人員認(rèn)為,設(shè)計(jì)一個(gè)能選擇性單一結(jié)合在某個(gè)RNA位點(diǎn)的靶向小分子藥物是天方夜譚。而且'這貨'還在不停的擺動(dòng)跳舞當(dāng)時(shí)的儀器設(shè)備很難清晰的解析清楚它的結(jié)構(gòu)。"

       Matthew Disney教授聳了聳肩:"過(guò)去我花了十年時(shí)間試圖馴服這個(gè)'家伙'。

       是的!我凌晨2點(diǎn)沖進(jìn)實(shí)驗(yàn)室,沉迷于此超過(guò)了生活,對(duì)于我來(lái)講這個(gè)領(lǐng)域出滿了不確定性和刺激。

       (筆者注:在翻譯這段采訪時(shí),筆者深深感觸到,這項(xiàng)領(lǐng)域的研究對(duì)迪斯尼教授來(lái)講堪比王者農(nóng)藥啊。。)

       "為什么我們有了基因剪切技術(shù)后我們還需要回到小分子藥物設(shè)計(jì)?"Matthew Disney教授自問(wèn)自答說(shuō):"基因剪切是近年來(lái)有革命性突破的逆向技術(shù),利用可以敲斷DNA或RNA鏈來(lái)治療疾病,雖然已經(jīng)衍生了幾類(lèi)藥物進(jìn)入市場(chǎng),但是**和大分子藥物遞送方式難題一直限制了它們的應(yīng)用。這使得我更渴望能回到使用小分子藥物繞過(guò)這些問(wèn)題。"

       "另一部分給予我的外在刺激是,迄今為止人類(lèi)發(fā)現(xiàn)的2萬(wàn)種蛋白序列中,只有15%可以用小分子藥物治療,但這些氨基酸序列的構(gòu)建都是由RNA中的mRNA(信使RNA)起到作用,所以靶向mRNA修改氨基酸的構(gòu)建便使得我們可以治療剩余85%的疾病。"

       "同行們都覺(jué)得我在做不可思議的事情,但我更傾向于自己在一場(chǎng)德州 撲 克 比賽中手握大牌。一旦我們攻克出一個(gè)方法,我們將創(chuàng)新出一大類(lèi)靶點(diǎn)藥物,特別對(duì)于罕見(jiàn)的遺傳病與目前一些無(wú)能為力的癌癥種類(lèi)。目前隨著技術(shù)的突破對(duì)RNA動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu)的深入了解,以及慢性病相關(guān)的RNA被不斷的發(fā)現(xiàn),已經(jīng)有十多家制藥與生物公司被重新拉回了這項(xiàng)事業(yè)中。"

       樂(lè)觀的Kevin M Week教授就是被吸引的學(xué)者之一,他覺(jué)得:"即使編碼蛋白在RNA中只占有1-2%,這些可'**'部分也會(huì)由巨大的機(jī)會(huì)。"

       但2000年時(shí),為Anadys 制藥公司提供病毒RNA研究合作的加州大學(xué)圣地亞哥分校的RNA結(jié)構(gòu)學(xué)家Thomas Hermann教授卻對(duì)此不樂(lè)觀:"以我之前的工作經(jīng)驗(yàn)看,RNA的靶標(biāo)太復(fù)雜了,猶如在一堆黃鐵礦之中要挑選金子,這項(xiàng)工作是很難的。"

       筆者注:黃鐵礦是一種鐵的二硫化合物很容易被認(rèn)為是黃金

圖片來(lái)自:百度百科

       圖片來(lái)自:百度百科

       但是無(wú)論如何靶向RNA小分子的"淘金熱"已經(jīng)開(kāi)始了,下述十幾家公司中不乏制藥界巨頭的身影,百健,諾華,默克以及輝瑞紛紛在這一鄰域進(jìn)行投資或計(jì)劃進(jìn)入該領(lǐng)域。

       見(jiàn)下表:

RNA小分子的"淘金熱"

       Matthew Disney教授談道:"尋找到人體內(nèi)任何RNA靶標(biāo)的設(shè)想是大膽的,但我希望在敏感的RNA靶點(diǎn)上建立方法學(xué)模型,最終使其成為藥物研發(fā)領(lǐng)域發(fā)現(xiàn)藥物的成熟模式。"

       筆者補(bǔ)充:任何熟悉這個(gè)領(lǐng)域的理性人都能意識(shí)到,這個(gè)領(lǐng)域成功的故事不多,尋找了一下文獻(xiàn)庫(kù),僅有少數(shù)案例出現(xiàn)。

       它們分別是:

       1、氨基糖苷類(lèi)的抗生素與RNA的"混合分子"被發(fā)現(xiàn)。

       2、由默克的藥物學(xué)家Terry Roemer和其同事一起發(fā)現(xiàn)的名為Ribocil的可抑制病毒非編碼RNA的抗生素結(jié)構(gòu),在2015年10月這類(lèi)新型抗生素結(jié)構(gòu)被報(bào)道在《自然》雜志的封面頁(yè),堪稱(chēng)15年抗生素領(lǐng)域的重大發(fā)現(xiàn)之一,但由于抗生素本身抗性未能繼續(xù)進(jìn)一步成藥。

2

       3、諾華公司在15年開(kāi)發(fā)的針對(duì)脊髓性肌萎縮癥的藥物Branaplam,Branaplam通過(guò)復(fù)雜的作用機(jī)制使得mRNA再造來(lái)治療脊髓型機(jī)萎縮癥。

3

       4、由新銳Arrakis Therapeutics公司發(fā)布RNA未公開(kāi)靶點(diǎn)的藥物三路連接RNA后的復(fù)合物模型

4

       5、Ribometrix公司發(fā)布了一個(gè)未公開(kāi)小分子結(jié)構(gòu)與RNA靶點(diǎn)結(jié)合的模型

5

       在美國(guó)化學(xué)雜志對(duì)北卡大學(xué)的Kevin M Week教授采訪中談到Matthew Disney教授,他給予了高度的評(píng)價(jià):"許多研究院應(yīng)該感謝Matthew Disney教授十年如一日的堅(jiān)持,他使得這一研究領(lǐng)域復(fù)興,他慢慢的讓人們重新相信尋找小分子藥物靶向RNA的設(shè)計(jì)是合理的,十幾年以來(lái)他幾乎單槍匹馬的'活著'。"

       "現(xiàn)在大型制藥公司都為此領(lǐng)域投入資源,所以這并不是行業(yè)內(nèi)的一種時(shí)尚,這是腳踏實(shí)地的項(xiàng)目。"采訪中RNA Medicines Co公司的CEO Johan Pontin說(shuō)道。

       筆者評(píng):

       業(yè)界越來(lái)越多的公司開(kāi)始考慮回到開(kāi)發(fā)靶向RNA小分子藥物領(lǐng)域,目前進(jìn)入該領(lǐng)域的A輪風(fēng)頭資金已經(jīng)達(dá)到5500萬(wàn)美元,因Matthew Disney教授的推動(dòng),他們正在重新回到考慮在松散的RNA架構(gòu)上設(shè)計(jì)特異性靶向分子。

       現(xiàn)在Matthew Disney教授正在建立治療擴(kuò)展性重復(fù)疾病治療方案,他的實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)完成了靶向強(qiáng)直性營(yíng)養(yǎng)肌不良癥RNA的小分子藥物,通過(guò)阻止RNA中其不斷重復(fù)的CUG堿基突變來(lái)治療該疾病。同時(shí)他還致力于發(fā)現(xiàn)RNA特異性結(jié)合化合物的工具以及方法學(xué)的建立。

       Matthew Disney教授說(shuō)道:"我們最終希望完成這一方法學(xué)和工具,讓它可以使我們快速鑒定出對(duì)特異性RNA結(jié)構(gòu)有親和性的化合物。"

       相關(guān)圖片資料鏈接:

       美國(guó)化工協(xié)會(huì) Cover Story:Volume 95 Issue 47 > 《The RNA drug hunters》

       EvaluatePhrama公司預(yù)測(cè)報(bào)告《EP Vantage 2018 Preview》

       Ribocil:http://www.natureasia.com/zh-cn/nature/highlights/69082/

       Branaplam:Nat. Chem. Biol. 2015, DOI: 10.1038/nchembio.1837

       Matthew Disney教授的研究工作:Nat. Chem. Biol. 2016, DOI: 10.1038/nchembio.2251

         作者簡(jiǎn)介:陳斌,復(fù)旦藥學(xué)院研究生,研究方向:天然產(chǎn)物活性成分的藥物分析方法學(xué)建立,天然藥物的質(zhì)量控制研究,發(fā)表《多種生產(chǎn)工藝對(duì)市售門(mén)冬氨酸鉀鎂注射制劑質(zhì)量影響的評(píng)價(jià)》。

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