最初,CRISPR只是細菌體內(nèi)的一個“免疫機制”,用于防御入侵病毒和外源DNA。隨著研究深入,CRISPR被科學家們“化為己用”,基于此實現(xiàn)了基因刪除、插入、激活、大片段以及染色體敲除等可能。如今,CRISPR已經(jīng)成為糾正突變基因、解決器官異種移植關(guān)鍵難題、治療疑難雜癥等領(lǐng)域的熱門技術(shù)。
現(xiàn)在,由哈佛大學的遺傳學教授喬治?丘奇(George Church)領(lǐng)導的研究團隊利用“魔剪”技術(shù)對細胞進行了13,200次基因改造,創(chuàng)下了基因編輯領(lǐng)域的一項記錄。
他們希望,以更大規(guī)模重寫基因組,這最終可能會導致物種被“重新設計”。
大規(guī)?;蚓庉?/strong>
這種大規(guī)模的基因編輯之前已有研究團隊嘗試過。2017年,由Paul Thomas帶領(lǐng)的一個澳大利亞團隊使用CRISPR對小鼠的Y染色體進行了編輯,并成功將其整個刪除了。這一策略被認為是唐氏綜合征的潛在治療方法。
因為CRISPR會切開DNA雙螺旋結(jié)構(gòu),一次進行太多編輯會殺死細胞,這限制了過去大規(guī)模編輯的嘗試。來自澳大利亞昆士蘭大學的Geoff Faulkner團隊曾在2016年嘗試敲除500個小鼠胚胎中的LINE片段,以此確定這一編輯對小鼠發(fā)育和行為的影響。但是,并沒有小鼠存活下來。
George Church團隊的新嘗試
為了打破新的基因編輯記錄,哈佛團隊將CRISPR“瞄準”一段DNA序列:LINE-1,一種遍布人體基因組的重復片段,可以自我復制,約占基因組的17%。
為了避免細胞死亡的問題,哈佛團隊改版了傳統(tǒng)的CRISPR,研發(fā)了一套單堿基編輯技術(shù)——dead-Cas9 base editor(dBEs),可以避免切割DNA,而是用一個堿基替換另一個,例如將C轉(zhuǎn)換為T。最終,他們可以在細胞內(nèi)編輯超13000次,且不會殺死細胞。這項研究成果于3月發(fā)表在預印本雜志bioRxiv。
學界觀點
有學者認為,這項工作提供了一種方法進行試驗且不會導致全基因組不穩(wěn)定。但是也有人持懷疑態(tài)度,他們認為這項工作并不足以“啟動”大規(guī)?;蚪M編輯。澳大利亞國立大學的Gaetan Burgio稱,該技術(shù)宣稱的對物種進行重新設計系“夸大其詞”。
然而,George Church認為,大規(guī)模基因編輯是“清理基因組”(去除其中垃圾)的一種方法。2015年,他實驗室清除了豬基因組中潛伏的62份逆轉(zhuǎn)錄病毒遺傳物質(zhì)。這些病毒會被重新激活,這對于“器官異種移植”而言是一個大隱患。當時研究團隊使用的是一種“不朽”的豬腎 臟細胞(可以在培養(yǎng)皿中無限地生存和分化)。
同年,他和學生楊璐菡共同創(chuàng)辦了一家生物技術(shù)公司eGenesis,計劃利用CRISPR技術(shù)來實現(xiàn)豬異種器官移植到人體。2017年,他們成功在活體豬身上證實了這一可行性,收獲世界首批內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒基因失活的幼豬。相關(guān)研究成果發(fā)表在《Science》期刊。
George Church表示,他的最終目標是創(chuàng)建人體基因組已經(jīng)被修改過的器官和組織,能夠?qū)λ胁《径济庖?。這一過程被稱為“重新編碼”(recoding),將涉及約9811個精準的基因修飾。目前,George Church實驗室已經(jīng)開始了相關(guān)工作,在實驗室對他自己的細胞進行重新編碼。
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