新發(fā)現(xiàn)！NSCLC患者一代TKI厄洛替尼的耐藥原因

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來源：生物探索

2019-04-09

安諾優(yōu)達(dá)攜手廈門弘愛醫(yī)院孔祥泉主任團(tuán)隊(duì)研究發(fā)現(xiàn)，非小細(xì)胞肺癌患者在接受一代TKI厄洛替尼治療過程中產(chǎn)生耐藥，通過高通量測(cè)序技術(shù)發(fā)現(xiàn)其可能的耐藥位點(diǎn)為EGFR Y891D，并對(duì)其耐藥機(jī)制進(jìn)行了研究。這也是國(guó)際上首次對(duì)該耐藥位點(diǎn)進(jìn)行報(bào)道，為腫瘤的臨床治療提供了新的策略。該研究成果見刊腫瘤領(lǐng)域權(quán)威雜志Journal of Thoracic Oncology （IF=10.34）。

研究背景

在歐美（5-15%）、東亞地區(qū)（40-55%）的非小細(xì)胞肺癌（NSCLC）患者中，發(fā)現(xiàn)存在表皮生長(zhǎng)因子受體（EGFR）酪氨酸激酶域的激活突變。其中，最常見的突變包括EGFR 外顯子19缺失和21外顯子L858R點(diǎn)突變，該兩種突變類型占臨床EGFR 突變的90%左右。目前已知的一代和二代EGFR TKI耐藥原因包括：40-55% EGFR T790M點(diǎn)突變，10-15% ERBB2 擴(kuò)增，10%小細(xì)胞肺癌的轉(zhuǎn)移，10% EGFR 擴(kuò)增并伴隨T790M 點(diǎn)突變，5% MET 擴(kuò)增，1% BRAF 突變，1% KRAS 突變，2-3% PI3K 突變，1-2% MET 突變，除此之外，還有10%左右的耐藥機(jī)理尚不清楚。本文首次報(bào)道了攜帶有EGFR L858R/Y891D NSCLC患者對(duì)厄洛替尼治療所產(chǎn)生耐藥現(xiàn)象，并揭示其潛在機(jī)制，該結(jié)果為臨床治療策略提供了新思路。

病例簡(jiǎn)介

患者，男，有吸煙史，55歲。2014年1月確診為肺腺癌，行右肺中葉癌根治術(shù)，術(shù)后病理診斷為右中肺周圍型中-高分化腺癌p T2aN2M0 IIIa期，大部分為原位腺癌，侵犯肺臟層胸膜下。組織ARMS PCR測(cè)序結(jié)果表明，該患者含有EGFR L858R 突變（Fig. 1A, 1E)。術(shù)后行4周期培美曲塞聯(lián)合順鉑化療，定期隨訪。

2017年6月，患者顱腦MRI提示，為腦多發(fā)轉(zhuǎn)移瘤，評(píng)價(jià)病情為進(jìn)展?；颊咝修D(zhuǎn)移瘤病灶伽馬刀治療，50%等劑量線，周邊劑量為11Gy，13Gy，中心劑量為22Gy，26Gy，治療次數(shù)2次，同時(shí)，行吉非替尼靶向治療。PET-CT查體顯示，術(shù)區(qū)未見明顯明確腫瘤復(fù)發(fā)征象，右側(cè)枕葉、左側(cè)頂葉低密度影并FDG代謝減低，為腫瘤治療后改變?；颊週3椎體骨轉(zhuǎn)移，L4椎體下緣骨轉(zhuǎn)移，行L3、L4病灶伽馬刀治療。

2017年9月，患者顱腦MRI復(fù)查結(jié)合胸部CT、腹部CT、ECT和脊椎MRI，結(jié)果提示為腦多發(fā)轉(zhuǎn)移瘤伴有骨轉(zhuǎn)移，療效評(píng)價(jià)為進(jìn)展（Fig. 1B）。CT結(jié)果顯示，左肺新增多發(fā)小結(jié)節(jié)，同時(shí)，患者停用吉非替尼治療。胸水送安諾優(yōu)達(dá)NGS測(cè)序，結(jié)果顯示，患者含有EGFR L858R/Y891D雙突變。從患者樣本中檢出EGFR L858R和Y891D，變異等位基因頻率（VAF）分別為70.61%和70.66%（Fig. 1A, 1E）。并顯示EGFR L858R 為熱點(diǎn)突變，而EGFR Y891D在人群數(shù)據(jù)庫（1000 genomes，ESP6500，ExAC）及COSMIC、Clinvar、TCGA數(shù)據(jù)庫中均無記錄。

放療后，患者進(jìn)行厄洛替尼150mg qd靶向治療三個(gè)月，療效評(píng)價(jià)為進(jìn)展。顱腦MRI和肺部CT，提示腦多發(fā)轉(zhuǎn)移瘤進(jìn)展伴有右胸膜轉(zhuǎn)移（Fig. 1C），提示患者一代EGFR-TKI 厄洛替尼耐藥。替莫唑胺化療配合顱腦放療治療后，胸水送安諾優(yōu)達(dá)NGS測(cè)序，結(jié)果顯示，患者仍存在EGFR L858R/Y891D雙突變，變異等位基因頻率（VAF）分別為1.19%和1.37%（Fig. 1A, 1E）。

研究團(tuán)隊(duì)通過Rosetta軟件嘗試計(jì)算模擬EGFR L858R/Y891D可能導(dǎo)致耐藥的原因。首先，對(duì)EGFR L858R或L858R/Y891D分別與ATP或厄洛替尼所形成復(fù)合物建模。其次，計(jì)算這些復(fù)合物的能量。與L858R相比，EGFR L858R/Y891D與ATP的結(jié)合優(yōu)于厄洛替尼（ΔΔG=3.87 Rosetta能量單位）（Fig. 2C），結(jié)果表明，額外的Y891D增加了L858R與自然底物ATP的敏感性。蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模擬結(jié)果提示，EGFR L858R/Y891D雙突變可能為厄洛替尼耐藥原因（Fig. 2）。

2018年6月，患者奧西替尼治療至今，療效評(píng)價(jià)為穩(wěn)定。

小結(jié)

安諾優(yōu)達(dá)始終堅(jiān)持“用科技和創(chuàng)新提升生命品質(zhì)”的使命，在腫瘤檢測(cè)領(lǐng)域持續(xù)探索。在本案例中，安諾優(yōu)達(dá)研究團(tuán)隊(duì)對(duì)帶有EGFR 突變的NSCLC患者的多線化療和靶向治療的治療歷程進(jìn)行了回顧總結(jié)，通過應(yīng)用高通量測(cè)序技術(shù)，發(fā)現(xiàn)該患者在使用一代TKI厄洛替尼時(shí)，其可能存在以往公共數(shù)據(jù)庫及文獻(xiàn)中從未報(bào)道過的新的耐藥位點(diǎn)——EGFR Y891D，不僅豐富了EGFR 耐藥位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫，還對(duì)后期藥物的研發(fā)提供新的作用靶點(diǎn)，輔助臨床的治療決策。多時(shí)間點(diǎn)動(dòng)態(tài)檢測(cè)結(jié)果提示，NSCLC患者存在腫瘤異質(zhì)性，該動(dòng)態(tài)檢測(cè)結(jié)果可為患者后期的治療策略的選擇提供新思路。

在該病例的研究分析過程中，不僅體現(xiàn)了安諾優(yōu)達(dá)高要求、嚴(yán)質(zhì)控、高準(zhǔn)確度的檢測(cè)實(shí)力，也通過新位點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)說明了安諾優(yōu)達(dá)在腫瘤報(bào)告解讀方面的專業(yè)性。為了能夠讓每一位患者更多的得到報(bào)告的信息，安諾優(yōu)達(dá)采用“自動(dòng)化解讀+人工解讀”的雙重復(fù)合解讀機(jī)制，在自動(dòng)化數(shù)據(jù)庫解讀基礎(chǔ)之上，安諾優(yōu)達(dá)遺傳咨詢團(tuán)隊(duì)對(duì)每一份報(bào)告都會(huì)再進(jìn)行人工復(fù)合，針對(duì)患者的臨床情況，做深入的數(shù)據(jù)庫挖掘分析，力爭(zhēng)為患者出具一份更加完整、精準(zhǔn)的報(bào)告，為臨床在選擇用藥時(shí)提供解決方案，實(shí)現(xiàn)個(gè)體化精準(zhǔn)治療。

“免疫治療現(xiàn)已成為腫瘤治療研究的新方向，且由于腫瘤存在時(shí)間、空間異質(zhì)性的特點(diǎn)，在腫瘤的精準(zhǔn)診療工作上，安諾優(yōu)達(dá)的研究從未止步，最新推出了安譜健—868實(shí)體瘤分子診斷，實(shí)現(xiàn)免疫治療多維度檢測(cè)（包括TMB水平、PD-L1表達(dá)、MSI檢測(cè)、免疫治療療效相關(guān)基因變異檢測(cè)）以及實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)腫瘤克隆演化過程及耐藥情況，實(shí)現(xiàn)對(duì)患者的全病程管理。并可對(duì)覆蓋FDA、EMA、CFDA、NCCN、CSCO指南推薦、臨床試驗(yàn)階段的288種靶向藥物的全面解讀，支持多種樣本靈活檢測(cè)，盡可能的滿足臨床及患者的診療需求，致力于推動(dòng)國(guó)內(nèi)精準(zhǔn)醫(yī)療行業(yè)的發(fā)展，這也是安諾優(yōu)達(dá)不可推卸的社會(huì)責(zé)任。”

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