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CPHI制藥在線 資訊 安諾優(yōu)達引入全球首批Sequel II,助力三代測序技術應用

安諾優(yōu)達引入全球首批Sequel II,助力三代測序技術應用

來源:安諾優(yōu)達
  2019-04-24
4月22日,PacBio SMRT測序技術高峰論壇在北京召開,本次會議上PacBio官方首次發(fā)布了備受矚目的Sequel II測序平臺。配置了全新的8M SMRT Cell,Sequel II單張芯片通量較Sequel平臺提升了8倍左右,數據質量方面也有明顯改善。

       4月22日,PacBio SMRT測序技術高峰論壇在北京召開,本次會議上PacBio官方首次發(fā)布了備受矚目的Sequel II測序平臺。配置了全新的8M SMRT Cell,Sequel II單張芯片通量較Sequel平臺提升了8倍左右,數據質量方面也有明顯改善。安諾優(yōu)達作為全球首批Sequel II 用戶,見證了本次新平臺的發(fā)布,并于今年5月底前正式對外提供Sequel II測序服務。

       Sequel II 平臺介紹

       Sequel II平臺仍舊采用了PacBio公司經典的SMRT 測序技術,將測序芯片SMRT cell進行了全新升級,芯片上的零模波導孔(ZMW)的數量由100萬升級到了800萬,大大提升了單張芯片的測序通量。目前Sequel II平臺運行CLR (continuous long read)文庫,采用10h的運行時間,單張芯片平均產出高達75Gb;而運行Hifi文庫 (highly accurate long reads),采用30h的運行時間,單張芯片平均產出高達250Gb,較前一代Sequel平臺有顯著提升。

       數據質量

       Sequel II平臺除測序通量進行了大幅提升之外,測試數據質量表現(xiàn)也非常優(yōu)異。PacBio SMRT測序時錯誤是隨機發(fā)生的,后續(xù)的分析可以進行自身校正,測序深度的增加會顯著提升reads的準確度。在Sequel II平臺上,達到40X的測序深度,序列的準確度可達99.999%(Q50),另外由于SMRT測序技術為單分子測序技術,沒有PCR擴增偏好性,因此對序列的GC含量沒有偏好性,在高/低GC含量區(qū)域,覆蓋仍舊非常均一。

       應用方向

       變異檢測

       SMRT測序技術由于其無PCR擴增偏好性和超長讀長的技術特點,非常適合做檢測結構變異檢測,目前升級后的Sequel II平臺采用Hifi 文庫進行CCS測序能夠顯著提升堿基準確度,做到同時兼顧長讀長和高準確度,除做結構變異檢測外,能夠適用于SNP、InDel等其它類型的變異檢測。

       基因組組裝

       PacBio SMRT測序已經成為目前基因組組裝中廣泛使用的技術手段,Sequel II平臺的推出將使得基因組組裝的成本進一步下降,結合CLR文庫進行大片段測序,未來SMRT技術在基因組組裝領域的應該將得到進一步的拓展。

       全長轉錄組

       全長轉錄組采用Sequel II平臺的Hifi文庫進行測序,單張SMRT Cell將產出更多的polymerase reads和更長的酶讀長,通過CCS糾錯,能夠幫助研究者獲得更多高質量的全長轉錄本,助力可變剪切、融合基因等的深入研究。

       安諾實力

       安諾優(yōu)達基因科技成立于2012年,總部位于北京,是中國基因組行業(yè)知名企業(yè),專注于新一代基因組學技術在人類醫(yī)學健康和生命科學研究兩大領域的產業(yè)化應用。自2017年安諾優(yōu)達推出了三代測序以來,已經搭建了成熟的三代基因組組裝、變異檢測、轉錄組學、表觀組學分析流程,并且積累了豐富的項目經驗。尤其是針對于三代測序在醫(yī)學上的應用,推出了基于三代人重測序為核心的多組學精準解決方案,不僅可以解析全基因組變異信息,進行表型相關性分析、顯性/隱性遺傳模式分析、復合雜合遺傳模式分析以及靶向藥物反應分析等,還可以通過與Hi-C、RNA-seq等多組學聯(lián)合解析腫瘤、疾病發(fā)病機制,助力人類疾病與健康研究。

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