生物體中頭部和腹部不同器官的細(xì)胞都包含相同的基因組,但不同類型細(xì)胞在分化后只表達(dá)一部分基因子集,可稱為細(xì)胞特異性表達(dá)。
近日,來自紐約大學(xué)(NYU)生物學(xué)系的Stephen Small教授所帶領(lǐng)的研究團(tuán)隊探索了胚胎形成過程中細(xì)胞特異性表達(dá)的基因其啟動子的激活機(jī)制,為細(xì)胞是如何分化而變得彼此不同給出了一些答案,相關(guān)結(jié)果發(fā)表在《Molecular Cell》上。
細(xì)胞特異性基因表達(dá)
科學(xué)家們早就認(rèn)識到了生命體遵循“Crick 中心法則”。這一法則所描述的遺傳信息傳遞的過程為:從DNA轉(zhuǎn)錄成為RNA, 再從RNA翻譯為蛋白質(zhì)執(zhí)行生物學(xué)功能;這也是基因表達(dá)的過程??茖W(xué)家們此前已經(jīng)識別了基因表達(dá)由啟動子作為“開/關(guān)”,就像水龍頭一樣,但這些啟動子到底是如何被激活的卻不得而知。
此次,研究人員將目光聚焦在了一個果蠅胚胎發(fā)育過程中稱為“駝背基因”的hunchback (hb)基因上。hb基因能使果蠅胚胎頭部的細(xì)胞發(fā)育成為與腹部不同的細(xì)胞,也可以理解為hb基因在果蠅頭部細(xì)胞中特異性表達(dá), 對頭部細(xì)胞的分化起著重要的作用。
雙啟動子“開關(guān)”
研究人員通過實驗獲得了hb啟動子上的DNA序列,但卻進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)hb基因?qū)嶋H上有兩個啟動子P1和P2。其中P1 是活性啟動子,具有兩個關(guān)鍵功能域—— Zelda 結(jié)合域和TATA序列,決定了啟動子的活性;P1的激活經(jīng)發(fā)現(xiàn)是由一種叫做Bicoid轉(zhuǎn)錄因子的蛋白操控的,其具體的操控機(jī)制為:Bicoid與另一種與P1相距甚遠(yuǎn)的DNA序列(稱為增強(qiáng)子)相結(jié)合。
一旦這種結(jié)合形成,Bicoid就隨后再結(jié)合到P1上并使其激活,讓bh基因得以表達(dá)。因此,像眾多基因的表達(dá)途徑一樣,如果P1被關(guān)閉,hb基因就會沉默并停止表達(dá);當(dāng)P1被Bicoid激活,hb基因的轉(zhuǎn)錄就會開啟,從而進(jìn)行表達(dá)。
然而,P2則是一個非活性啟動子,并不具有Zelda和TATA兩個功能域 ,因此不能像P1一樣對Bicoid產(chǎn)生反應(yīng)。
為了進(jìn)一步驗證啟動子的功能域,研究人員通過基因編輯敲除了P1上的Zelda和TATA序列,并發(fā)現(xiàn)該啟動子隨后失活。而當(dāng)把這兩個序列插入P2后,該啟動子產(chǎn)生了像P1一樣的功能活性。
“復(fù)雜的機(jī)體中包含有多種類型的細(xì)胞,每一種細(xì)胞類型都是獨特的,因為它能夠開啟一類細(xì)胞特異性基因的表達(dá),” Small教授評價說,“我們的研究結(jié)果揭示了在早期胚胎發(fā)育中,一個細(xì)胞特異性基因的表達(dá)是如何被開啟的。”
結(jié)語
科學(xué)家們一直知道改變特定基因的開啟有可能會導(dǎo)致出生缺陷或像癌癥這樣的嚴(yán)重疾病,但他們對驅(qū)動這種改變背后所蘊藏的復(fù)雜分子學(xué)機(jī)制尚不完全清楚。本項研究為生命活動的遺傳基礎(chǔ)提供了新的見解,并有助于更好地了解疾病的發(fā)生和出生缺陷。
參考資料:
[1] Biologists discover the intricacies of "on/off switch" that creates cell differentiation
[2] Bicoid-DependentActivation of the Target Gene hunchback Requires a Two-Motif Sequence Code in aSpecific Basal Promoter
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