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CPHI制藥在線 資訊 創(chuàng)新藥:大環(huán)結(jié)構(gòu)不僅是突破專利 更多是解決問題

創(chuàng)新藥:大環(huán)結(jié)構(gòu)不僅是突破專利 更多是解決問題

作者:藥瘋  來源:新浪醫(yī)藥新聞
  2022-02-08
對于小分子化學(xué)創(chuàng)新藥,結(jié)構(gòu)是一切藥物特點的基礎(chǔ)。但,之所以存在如此多的“me-too”藥物,就是因為同類藥物很難逃脫已報導(dǎo)的本領(lǐng)域技術(shù)人員可推測的成藥結(jié)構(gòu)范圍。

       對于小分子化學(xué)創(chuàng)新藥,結(jié)構(gòu)是一切藥物特點的基礎(chǔ)。但,之所以存在如此多的“me-too”藥物,就是因為同類藥物很難逃脫已報導(dǎo)的本領(lǐng)域技術(shù)人員可推測的成藥結(jié)構(gòu)范圍。為了即獲得知識產(chǎn)權(quán)保護(hù),又突破行業(yè)傳統(tǒng)的“me-too”眼光,并同時具備很高的成藥屬性,大環(huán)結(jié)構(gòu)越來越多的被應(yīng)用到結(jié)構(gòu)設(shè)計當(dāng)中,今天就通過幾個例子,來和大家共同感受下大環(huán)結(jié)構(gòu)對于小分子化學(xué)藥物結(jié)構(gòu)突破的重要性。

       1.舊事重提 EGFR經(jīng)典結(jié)構(gòu)

       化學(xué)創(chuàng)新藥,結(jié)構(gòu)是一切藥物特點的基礎(chǔ)。但,之所以存在如此多的“me-too”藥物,就是因為同類藥物很難逃脫已報導(dǎo)的本領(lǐng)域技術(shù)人員可推測的成藥結(jié)構(gòu)范圍。為了即獲得知識產(chǎn)權(quán)保護(hù),又突破行業(yè)傳統(tǒng)的“me-too”眼光,并同時具備很高的成藥屬性,大環(huán)結(jié)構(gòu)越來越多的被應(yīng)用到結(jié)構(gòu)設(shè)計當(dāng)中,今天就通過幾個例子,來和大家共同感受下大環(huán)結(jié)構(gòu)對于小分子化學(xué)藥物結(jié)構(gòu)突破的重要性。

       每當(dāng)說到大環(huán)、扣環(huán),就不得不說說肺癌經(jīng)典靶標(biāo)EGFR的2個重磅藥物,厄洛替尼和??颂婺幔@也是業(yè)內(nèi)人士談環(huán)必談的兩個結(jié)構(gòu),我們先溫習(xí)下這兩個藥物。

       ? 厄洛替尼

厄洛替尼

       EGFR抑制劑,開發(fā)公司為羅氏公司的基因泰克和安斯泰來,首批時間為2004年(FDA),商品名Tarceva,該藥臨床主要用于非小細(xì)胞肺癌的治療。Tarceva為口服片劑,每片含25 mg、100 mg或150 mg厄洛替尼。推薦劑量對于非小細(xì)胞肺癌,每次150 mg,每日1次,空腹服用。

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       開發(fā)公司為貝達(dá)藥業(yè)(Beta),首批時間為2011年(CFDA),商品名為Conmana/凱美納,為EGFR具有敏感基因突變的局部晚期或轉(zhuǎn)移性非小細(xì)胞肺癌的一線治療。Conmana/凱美納為口服片劑,每片含有125mg??颂婺?;推薦劑量為成人每次125 mg,每日3次。

       那么,以今天的眼光來看這兩個結(jié)構(gòu),對于本領(lǐng)域技術(shù)人員來說,可能不算很大的突破,但在曾經(jīng)的那個年代,最終可以開發(fā)為國內(nèi)創(chuàng)新藥的重磅級品種,算是很能代表當(dāng)時國內(nèi)新藥研發(fā)的創(chuàng)新技術(shù)水平。

       2.大環(huán)結(jié)構(gòu)可能產(chǎn)生的技術(shù)效果

       大環(huán)僅僅是為了突破專利嗎?從結(jié)構(gòu)的角度來說,是可以突破新穎性的,但以今天本領(lǐng)域技術(shù)人員的專業(yè)性來看,很難突破創(chuàng)造性。那么,就必須找到一些意想不到的技術(shù)效果,比如一些其他成藥性特點的突破,下面舉幾個例子。

       ? 活性舉例

       BACE抑制劑的開發(fā)過程,有研究者對蛋白進(jìn)行了研究分析,并以此設(shè)計了大環(huán)環(huán)合結(jié)構(gòu),活性得到了明顯的提升,如下圖所示。

活性舉例

       圖2.1 大環(huán)結(jié)構(gòu)-活性提升

       ? 選擇性舉例

       下述大環(huán)類氨基嘧啶化合物作為多靶點CDK和VEGFR抑制劑具有良好的生物活性,同時,在大環(huán)骨架連接區(qū)做結(jié)構(gòu)修飾,通過磺胺基的引入可以影響化合物對靶點的選擇性,結(jié)構(gòu)如下圖所示。

大環(huán)結(jié)構(gòu)-選擇性提升

       圖2.2 大環(huán)結(jié)構(gòu)-選擇性提升

       ? 理化性質(zhì)舉例

       有研究者報道了JAK2和FLT3大環(huán)抑制劑,適應(yīng)癥指向骨髓纖維化和淋巴瘤;在大環(huán)骨架上進(jìn)行不同的取代基修飾,水溶性得到了很好地提升;當(dāng)然,這個例子主要是介紹在大環(huán)成環(huán)后,側(cè)鏈的修飾。

大環(huán)結(jié)構(gòu)-理化性質(zhì)提升       

圖2.3 大環(huán)結(jié)構(gòu)-理化性質(zhì)提升

       3.大環(huán)結(jié)構(gòu)成功案例

       首先,有研究者對近10年左右的大環(huán)類上市藥物進(jìn)行了梳理(詳見下表),上市品種分布于各個適應(yīng)癥領(lǐng)域,大家可根據(jù)各自的研究方向進(jìn)行檢索學(xué)習(xí)。

大環(huán)類上市藥物

       這里,筆者對上述幾個品種及其他臨床在研品種進(jìn)行簡單的介紹,進(jìn)一步共同學(xué)習(xí)大環(huán)結(jié)構(gòu)獲得成功的案例。

       ? 開鏈克唑替尼vs大環(huán)勞拉替尼

       開發(fā)公司均為輝瑞,但時間相差了7年??诉蛱婺幔状紊鲜袝r間為2011年,為間變性淋巴瘤激酶ALK抑制劑,藥物療效不錯,但存在耐藥和難以進(jìn)入中樞的缺點。為此,研制出升級品種勞拉替尼,于2018年獲批上市。結(jié)構(gòu)優(yōu)化過程見下圖。

從克唑替尼到勞拉替尼       

圖3.1 從克唑替尼到勞拉替尼

       ? EGFR大環(huán)抑制劑BI-4020

       開發(fā)公司為勃林格殷格翰,最初的先導(dǎo)化合物(IC50為微摩爾級別)源于三突變EGFR(EGFRdeI19/T790M/C797S)和野生EGFR蛋白對化合物的篩選,后逐漸優(yōu)化,得到了大環(huán)化合物BI-4020。結(jié)構(gòu)優(yōu)化過程見下圖。

       EGFR大環(huán)抑制劑BI-4020的結(jié)果演變

圖3.2 EGFR大環(huán)抑制劑BI-4020的結(jié)果演變

       ? 凝血因子FXIa抑制劑

       XIa因子是繼Xa因子后,現(xiàn)階段非?;馃岬囊粋€抗凝領(lǐng)域的靶點,開發(fā)公司已有很多,并有多個品種進(jìn)入到臨床,國內(nèi)跟的也很緊,這里主要介紹BMS公司的咪唑類結(jié)構(gòu),并逐漸以大環(huán)類結(jié)構(gòu)開發(fā)推進(jìn)。結(jié)構(gòu)優(yōu)化過程見下圖。

凝血因子FXIa抑制劑的大環(huán)結(jié)構(gòu)       

圖3.3 凝血因子FXIa抑制劑的大環(huán)結(jié)構(gòu)

       4.感觸

       綜上,是筆者對于大環(huán)類結(jié)構(gòu)藥物一些初步的掃盲介紹。當(dāng)我們看到品種最終以大環(huán)結(jié)構(gòu)進(jìn)行開發(fā)推進(jìn)的過程時,除了專利的突破、成藥性的提升外,還有一個非常重要的因素常被忽略,那就是分子的可合成性。大環(huán)類結(jié)構(gòu),不僅需要對蛋白結(jié)構(gòu)的深入了解、分子結(jié)構(gòu)的空間柔性感知,同時還要考慮大環(huán)結(jié)構(gòu)的化學(xué)特點、可合成特點,否則對于一個藥物化學(xué)研究者來說,很容易逐漸走向眼高手低的道路,脫離現(xiàn)實而不自知。所以,大環(huán)類結(jié)構(gòu)的研究,仍是一條需多學(xué)科共同努力以推進(jìn)藥物結(jié)構(gòu)探索的路徑。

       參考資料:

       1. Design synthesis and biological evaluation of macrocyclic derivatives as TRK nhibitors. Sciencedirect

       2. First macrocyclic 3rd-generation ALK inhibitor for treatment of ALK/ROS1 cancer: Clinical and designing strategy update of lorlatinib. Sciencedirect

       3. 大環(huán)骨架在抗腫瘤藥物研究開發(fā)中的應(yīng)用. CNKI

       4. 大環(huán)小分子藥物. 郭宗儒. CNKI

       5. 大環(huán)化合物在藥物設(shè)計中的應(yīng)用及合成策略. CNKI

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