反義寡核苷酸(ASO)是一種短的合成核酸分子,被設(shè)計(jì)為與細(xì)胞內(nèi)的目標(biāo) mRNA 序列互補(bǔ),以影響 RNA 加工和/或改變蛋白質(zhì)表達(dá)水平。目前,美國已批準(zhǔn)了十幾種不同的 ASO 用于治療各種疾病。
ASO 已成為治療遺傳疾病的一種特別有吸引力的策略。然而,盡管前景令人鼓舞,但個性化 ASO 的設(shè)計(jì)和臨床前評估所需的時間和成本巨大,阻礙了這一策略的更廣泛應(yīng)用。
誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSC)已成為模擬發(fā)育過程和剖析疾病病理的強(qiáng)大工具。近期,從患者來源的誘導(dǎo)多能干細(xì)胞生成三維類器官技術(shù)取得了顯著進(jìn)展,進(jìn)一步拓展了這些細(xì)胞系統(tǒng)的應(yīng)用潛力。然而,目前建立患者來源的誘導(dǎo)多能干細(xì)胞模型的方法可能耗時且成本高昂。這些局限性常常阻礙患者來源模型充分發(fā)揮其針對所取材患者的治療潛力。
2025年1月22日,堪薩斯城兒童慈善醫(yī)院的研究人員在國際頂尖學(xué)術(shù)期刊 Nature 上發(fā)表了題為:Rapid and scalable personalized ASO screening in patient-derived organoids 的研究論文。
該研究展示了一種快速、可擴(kuò)展的平臺,用于生成患者來源的類器官模型,并利用這些模型進(jìn)行個性化 ASO 療法的臨床前評估。該平臺為罕見遺傳病的個性化治療提供了新的工具和方法,具有廣泛的臨床應(yīng)用潛力。
以下是 DeepSeek 提供的論文總結(jié)(經(jīng)過生物世界修正):
這篇論文題為:Rapid and scalable personalized ASO screening in patient-derived organoids(在患者來源的類器官中進(jìn)行快速且可擴(kuò)展的個性化 ASO 篩選),發(fā)表在 Nature 雜志上。該論文的主要研究內(nèi)容是開發(fā)了一種快速、可擴(kuò)展的平臺,用于生成患者來源的類器官模型,并利用這些模型進(jìn)行個性化 ASO 的臨床前評估。以下是論文的主要內(nèi)容和解讀:
1、研究背景與動機(jī)
反義寡核苷酸(ASO)是一種短合成核酸分子,能夠通過與細(xì)胞內(nèi) mRNA 靶標(biāo)互補(bǔ)來影響其加工或蛋白質(zhì)表達(dá)水平。ASO 在治療罕見遺傳病方面取得了積極成果,尤其是針對特定基因突變的個性化 ASO 治療。
然而,盡管 ASO 療法很有潛力,但其設(shè)計(jì)和臨床前評估的時間和成本較高,限制了其廣泛應(yīng)用。目前,患者來源的誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSC)模型生成耗時且昂貴,阻礙了其在個性化治療中的應(yīng)用。
2、研究目標(biāo)
開發(fā)一種快速、可擴(kuò)展的平臺,用于生成患者來源的類器官模型,并利用這些模型進(jìn)行個性化 ASO 的臨床前評估,驗(yàn)證 ASO 在逆轉(zhuǎn)疾病相關(guān)表型方面的效果。
3、研究方法
iPSC 的生成:研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種基于外周血單個核細(xì)胞(PBMC)的 iPSC 重編程流程,能夠在 3 周內(nèi)生成 iPSC 細(xì)胞系。該方法使用了多種小分子抑制劑(例如CHIR99021、PD0325901、SB431542等)和生長因子(例如bFGF)的組合,顯著提高了重編程效率。
類器官生成:從患者來源的 iPSC 中生成三維類器官模型,包括心臟類器官和大腦類器官。這些類器官能夠重現(xiàn)疾病相關(guān)表型,并用于 ASO 療法的評估。
ASO 設(shè)計(jì)與遞送:設(shè)計(jì)了靶向特定基因突變的 ASO,并通過轉(zhuǎn)染技術(shù)將其遞送到類器官中。ASO 的設(shè)計(jì)包括針對翻譯起始位點(diǎn)、剪接供體和剪接受體位點(diǎn)的不同策略。
一個快速和可擴(kuò)展的平臺,用于生成患者衍生的細(xì)胞模型
4、主要發(fā)現(xiàn)
DMD 患者的 ASO 治療:研究團(tuán)隊(duì)成功地在杜氏肌營養(yǎng)不良(DMD)患者來源的心臟類器官中驗(yàn)證了 ASO 的治療效果。通過 ASO 治療,恢復(fù)了 DMD 基因的表達(dá),逆轉(zhuǎn)了疾病相關(guān)表型。
個性化 ASO 設(shè)計(jì):針對兩名攜帶深內(nèi)含子突變的 DMD 患者,設(shè)計(jì)了兩種個性化 ASO,并在患者來源的心臟類器官中驗(yàn)證了其有效性。ASO 治療恢復(fù)了 DMD 基因的正常剪接,恢復(fù)了蛋白質(zhì)表達(dá)和心臟功能。
5、平臺優(yōu)勢
快速與可擴(kuò)展性:該平臺能夠在 6 周內(nèi)完成從 PBMC 獲取,到 ASO 療法效果評估的全流程,且不需要特殊設(shè)備或高成本試劑。
廣泛適用性:該平臺不僅適用于 ASO 療法的評估,還可以用于其他藥物開發(fā)方法,如高通量化合物的篩選。
6、未來展望
個性化治療的潛力:該平臺為個性化 ASO 療法的臨床前開發(fā)提供了快速、可靠的途徑,有望加速罕見遺傳病的治療進(jìn)展。
類器官模型的廣泛應(yīng)用:患者來源的類器官模型不僅可以用于 ASO 療法評估,還可以用于研究人類發(fā)育和疾病生物學(xué)的多個方面。
7、研究結(jié)論
該研究展示了利用患者來源的類器官模型進(jìn)行個性化治療評估的可行性。通過快速生成患者來源的類器官模型,研究團(tuán)隊(duì)能夠有效地設(shè)計(jì)和驗(yàn)證個性化 ASO,為罕見遺傳病的治療提供了新的可能性。
論文鏈接:
https://www.nature.com/articles/s41586-024-08462-1
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