在微觀世界的生存博弈中,噬菌體(專門感染細菌的病毒)與宿主(細菌)的對抗堪稱進化史上的經(jīng)典戰(zhàn)爭。近年來發(fā)現(xiàn)的 ?KZ 類巨型噬菌體(基因組超過20萬堿基對),更是將這場病毒-細菌“軍備競賽”推向新的維度:
核級防御:這類噬菌體感染后會構建類似細胞核的蛋白質(zhì)結(jié)構,將自身基因組嚴密保護;
早期安全屋:在感染初期形成脂質(zhì)囊泡,保護病毒基因進行早期轉(zhuǎn)錄;
多重免疫逃逸:對傳統(tǒng)的 CRISPR 系統(tǒng)等防御機制幾乎完全免疫。
面對這種“銅墻鐵壁”般的防御體系,宿主細菌究竟是如何對抗這種超級入侵者的?讓科學家們困惑多年。
2025年3月19日,加州大學舊金山分校 Joseph Bondy-Denomy 副教授、北京化工大學馮越教授團隊合作,在國際頂尖學術期刊 Cell 上發(fā)表了題為:Jumbo phage killer immune system targets early infection of nucleus-forming phages 的研究論文。論文第一作者兼共同通訊作者李玉萍博士現(xiàn)為瑞士巴塞爾大學終身教軌助理教授。
該研究發(fā)現(xiàn)了細菌中首個針對巨型噬菌體(jumbo phage)的防御系統(tǒng)——jumbo phage killer(簡稱為Juk),并揭示了其工作機制,為細菌抗巨型噬菌體系統(tǒng)研究提供了新方向。
李玉萍博士,2011年本科畢業(yè)于華中科技大學,2019年博士畢業(yè)于斯坦福大學,此后在加州大學舊金山分校進行博士后研究工作,2024年10月加入瑞士巴塞爾大學,任終身教軌助理教授。李玉萍博士獲得了瑞士國家科學基金(SNSF)資助,用于探索噬菌體-細菌互作,以開發(fā)下一代噬菌體療法。
Juk 系統(tǒng):細菌的精準防御系統(tǒng)
研究團隊通過對銅綠假單胞菌 PA14 菌株的基因篩查,意外發(fā)現(xiàn)了兩個關鍵基因——jukA 和 jukB。這套系統(tǒng)展現(xiàn)出令人驚嘆的防御特性:
● 精準識別:只攻擊 ?KZ 家族噬菌體,對 25 種其他噬菌體“視而不見”;
● 非自殺防御:清除入侵噬菌體后,細菌能繼續(xù)正常分裂(與傳統(tǒng)自殺式防御截然不同);
● 高效攔截:在感染后 5 分鐘內(nèi)即可瓦解噬菌體的防御體系。
實驗數(shù)據(jù)顯示,裝備 Juk 系統(tǒng)的細菌在遭遇噬菌體攻擊時,防御成功率提升超過百萬倍。
Juk 如何實現(xiàn)精準打擊?
通過熒光標記和超高分辨率成像,研究團隊揭開了 Juk 系統(tǒng)的分子機制:
1、雷達鎖定:JukA 蛋白如同預警雷達,通過識別噬菌體早期分泌的 gp241 蛋白,準確定位感染部位;
2、導 彈部署:JukB 效應蛋白被招募至感染位點,組裝成四聚體“穿 甲彈”;
3、精確打擊:JukB 在噬菌體的脂質(zhì)囊泡上打孔,暴露其遺傳物質(zhì)給宿主核酸酶;
4、清除殘?。罕黄茐牡氖删w基因組在 15 分鐘內(nèi)被降解殆盡。
有趣的是,gp241 蛋白自帶“定位器”——其跨膜結(jié)構域幫助 Juk 系統(tǒng)精準鎖定感染部位,而可溶性結(jié)構域則作為激活信號。
跨物種的防御網(wǎng)絡:Juk系統(tǒng)的進化智慧
對 5300 多個微生物基因組的分析顯示,Juk 系統(tǒng)展現(xiàn)出驚人的進化適應性:
模塊化設計:核心傳感器 JukA 可搭配不同效應器(磷脂酶、核酸酶等),形成多樣化防御組合;
廣泛分布:在變形菌門、藍細菌等 21% 的已測序細菌中存在;
協(xié)同防御:常與其他免疫系統(tǒng)(如限制修飾系統(tǒng))形成防御矩陣。
例如在熒光假單胞菌中,JukA 與磷脂酶融合形成“二合一”武器,通過分解噬菌體囊泡膜脂質(zhì)實現(xiàn)防御。
新型抗菌療法的曙光
這項突破不僅改寫了對宿主-噬菌體互作的認知,更為解決抗生素耐藥危機提供新思路:
1、精準抗菌:利用 Juk 系統(tǒng)的特異性,開發(fā)針對耐藥菌的噬菌體療法;
2、智能工程:將 Juk 元件植入益生菌,構建“活體抗菌劑”;
3、分子藍圖:JukB 的孔道形成機制為新型抗菌肽設計提供模板。
將 Juk 系統(tǒng)與現(xiàn)有抗菌策略結(jié)合,未來或可打造針對超級細菌的“定向精準打擊系統(tǒng)”,為解決當前的抗生素耐藥危機帶來新思路。
李玉萍博士為論文第一作者(現(xiàn)為瑞士巴塞爾大學助理教授),北京化工大學碩士研究生關琳琳為論文第二作者,北京化工大學馮越教授、加州大學舊金山分校 Joseph Bondy-Denomy 教授及李玉萍博士為論文共同通訊作者。
論文鏈接:
https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(25)00258-2
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