在原核生物中,DNA 以三種形式發(fā)生甲基化修飾:N6-甲基腺嘌呤(6mA)、N4-甲基胞嘧啶(4mC)以及 5-甲基胞嘧啶(5mC)。這些 DNA 甲基化修飾雖然比例相對(duì)較低,但發(fā)揮著一系列關(guān)鍵作用,包括宿主基因組防御和轉(zhuǎn)錄調(diào)控。
在真核生物中,目前僅發(fā)現(xiàn) 5mC 在基因組上廣泛分布,6mA 在單細(xì)胞生物中有零星分布,而 4mC 是否存在仍是個(gè)謎。
2025年4月9日,奧地利科學(xué)技術(shù)研究所馮小琦團(tuán)隊(duì)(James Walker、張靜懿、劉亞林、許淑娟為論文共同第一作者)在國(guó)際頂尖學(xué)術(shù)期刊 Cell 上發(fā)表了題為:Extensive N4 Cytosine Methylation is Essential for Marchantia Sperm Function 的研究論文。
該研究首次證明了 4mC 在真核生物中的存在,并闡明了在精子成熟階段基因組中發(fā)生了廣泛的 4mC 修飾,這對(duì)于精子的發(fā)育與功能至關(guān)重要。
在這項(xiàng)最新研究中,研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),真核生物地錢(Marchantia polymorpha)的精子發(fā)生過程涉及兩波大規(guī)模的 DNA 甲基化重編程。第一波,5mC 從轉(zhuǎn)座子擴(kuò)展至整個(gè)基因組;第二波,4mC 特異性發(fā)生在基因區(qū)域(genic region),覆蓋超過 50% 的 CG 位點(diǎn)。
4mC 需要一種甲基轉(zhuǎn)移酶(MpDN4MT1a),該酶在精子發(fā)生后期特異性表達(dá)。敲除 MpDN4MT1a 基因會(huì)改變精子的轉(zhuǎn)錄組,導(dǎo)致精子游動(dòng)和生育缺陷,并損害受精后的發(fā)育。
這些研究結(jié)果揭示了真核生物中廣泛存在 4mC 修飾,鑒定出一個(gè)真核生物甲基轉(zhuǎn)移酶家族,并闡明了 4mC 在生殖發(fā)育中的生物學(xué)功能,從而擴(kuò)展了真核生物 DNA 功能性修飾的范圍。
該研究的核心發(fā)現(xiàn):
● 在地錢精子發(fā)生過程中會(huì)發(fā)生廣泛的 5mC 重編程;
● 在地錢的精子中,4mC 在 CG 位點(diǎn)上廣泛存在;
● 4mC 需要一種在精子發(fā)生晚期特異性表達(dá)的甲基轉(zhuǎn)移酶;
● 4mC 調(diào)控精子的 mRNA 含量、活力和生育能力。
總的來說,該研究首次證實(shí)了 4mC 在真核生物中的存在,揭示了在地錢精子成熟過程中基因組范圍內(nèi)編碼區(qū)的大規(guī)模 4mC 修飾,保障了精子的正常發(fā)育和正常功能,對(duì)精子命運(yùn)的重要決定性,發(fā)現(xiàn)并鑒定了負(fù)責(zé) 4mC 修飾的真核 4mC 甲基轉(zhuǎn)移酶——MpDN4MT1a。
該研究拓展了我們對(duì)于真核生物表觀遺傳學(xué)的認(rèn)知,發(fā)現(xiàn)了參與生殖發(fā)育過程至關(guān)重要的表觀遺傳學(xué)新修飾,開創(chuàng)了 4mC 在真核生物中功能的研究新方向,拓展了表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域的邊界。
論文鏈接:
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(25)00287-9
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