北京大學謝曉亮院士團隊發(fā)表y有關單細胞 Micro-C的最新Nature Genetics論文

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來源：生物世界

2025-07-08

在動物基因組中，被稱為增強子（enhancer）的調控性 DNA 元件控制著特定細胞類型中基因表達的精確時空模式。然而，增強子在細胞核內的空間組織以調控靶基因的方式，目前仍知之甚少。

在動物基因組中，被稱為增強子（enhancer）的調控性 DNA 元件控制著特定細胞類型中基因表達的精確時空模式。然而，增強子在細胞核內的空間組織以調控靶基因的方式，目前仍知之甚少。

2025 年 7 月 2 日，北京大學生物醫(yī)學前沿創(chuàng)新中心（BIOPIC）/昌平實驗室謝曉亮院士團隊在 Nature Genetics 期刊發(fā)表了題為：Single-cell Micro-C profiles 3D genome structures at high resolution and characterizes multi-enhancer hubs 的研究論文。

研究團隊開發(fā)了單細胞 Micro-C（scMicro-C）技術，這種是基于微球菌核酸酶（Micrococcal nuclease）的 3D 基因組圖譜技術，能夠以高分辨率描繪 3D 基因組結構，并表征了多增強子中心（multi-enhancer hub），即多個增強子與基因啟動子相關聯(lián)，形成空間簇。

2025 年 7 月 2 日，北京大學生物醫(yī)學前沿創(chuàng)新中心（BIOPIC）/昌平實驗室謝曉亮院士團隊在 Nature Genetics 期刊發(fā)表了題為：Single-cell Micro-C profiles 3D genome structures at high resolution and characterizes multi-enhancer hubs 的研究論文。

在這項最新研究中，研究團隊報道了單細胞 Micro-C（scMicro-C）技術。這是一種基于微球菌核酸酶（Micrococcal nuclease）的 3D 基因組圖譜技術，其空間分辨率提升至 5 kb。

這是一種基于微球菌核酸酶（Micrococcal nuclease）的 3D 基因組圖譜技術，其空間分辨率提升至 5 kb。

利用該技術，研究團隊鑒定出一種特殊的 3D 增強子結構--啟動子-增強子條紋（promoter-enhancer stripe，PES），這種結構能夠將基因的啟動子與多個增強子連接起來。PES 是由黏連蛋白介導的環(huán)擠壓（loop extrusion）作用形成的，這有可能將多個增強子帶到啟動子處。

此外，該研究還觀察到，在單細胞 3D 基因組結構中，具有 PES 的基因普遍存在多增強子中心（multi-enhancer hub），其中多個增強子與基因啟動子相關聯(lián)，形成空間簇。

在單細胞 3D 基因組結構中，具有 PES 的基因普遍存在多增強子中心（multi-enhancer hub），其中多個增強子與基因啟動子相關聯(lián)，形成空間簇。