人類諾如病毒(Human norovirus,HuNoV),也被稱為諾瓦克病毒,是全球急性胃腸炎的主要原因之一。HuNoV影響所有年齡組,具有高度傳染性,特別是免疫系統(tǒng)較弱的人群,并可能導(dǎo)致嚴(yán)重的臨床后果。由于 HuNoV 具有遺傳變異大、進(jìn)化快的特點(diǎn),這給抗病毒藥物的研發(fā)造成了極大挑戰(zhàn)。在全球范圍內(nèi),大多數(shù)胃腸炎病例是由大流行性 GII.4 人類諾如病毒(HuNoV)毒株引起的。據(jù)估計(jì),諾如病毒每年導(dǎo)致約 6.84 億人患病,約 21.2 萬(wàn)人死亡。衛(wèi)生系統(tǒng)和社會(huì)直接成本每年超過(guò)600 億美元。作為一種傳染性極強(qiáng)的腸道病原體,其對(duì)全球公共衛(wèi)生造成重大威脅,引起了國(guó)際上的廣泛關(guān)注。目前,還沒(méi)有批準(zhǔn)的疫苗和針對(duì) HuNoV 的特異性治療方法。
諾如病毒(Norovirus,NoV)是無(wú)包膜的單股正鏈 RNA 病毒。HuNoV的RNA 基因組長(zhǎng)約 7.7 kb,其基因組由三個(gè)開(kāi)放閱讀框(ORF)組成:ORF1 編碼一個(gè)多聚蛋白,該蛋白被病毒蛋白酶裂解為六個(gè)非結(jié)構(gòu)蛋白,其中包括 RNA 依賴的 RNA 聚合酶(RdRp),這是一種促進(jìn)病毒 RNA 復(fù)制的關(guān)鍵酶;ORF2 編碼主要衣殼蛋白 VP1,該蛋白結(jié)構(gòu)上分為S和 P區(qū)兩個(gè)相鄰的區(qū)域,其中 S區(qū)形成內(nèi)核,構(gòu)成 VP1 的底座;P 區(qū)形成拱樣結(jié)構(gòu)突出于內(nèi)核外,可進(jìn)一步分為 P1和P2亞結(jié)構(gòu)域;ORF3 編碼次要衣殼蛋白VP2,VP2具有穩(wěn)定病毒顆粒的作用。根據(jù)VP1 的氨基酸序列,NoV 被分類為至少10個(gè)基因組(GI-GX),這些基因組進(jìn)一步細(xì)分為49個(gè)基因型。在可感染人類的五種基因組(GI、GII、GIV、GVIII和GIX)中,GI 和GII 突變體是導(dǎo)致腸胃炎病例的主要病原體。特別是 GII.4 基因型長(zhǎng)期以來(lái)一直是全球胃腸炎暴發(fā)的主要原因,其變體每隔 2-4 年就會(huì)進(jìn)化成新的變體,因其高傳染性和引發(fā)大規(guī)模流行病的能力而聞名。
NoV基因組測(cè)序有助于開(kāi)發(fā)基于核酸的NoV 檢測(cè)方法。20世紀(jì)90年代中期,第一個(gè)以 ORF1 中RNA 聚合酶基因相對(duì)保守區(qū)為靶點(diǎn)的 RT-PCR 被用于檢測(cè) NoV。此后,針對(duì) NoV開(kāi)發(fā)了更多實(shí)時(shí)、快速和靈敏的分子檢測(cè)方法,包括 RT-qPCR、微滴數(shù)字 RT-PCR、多重 RT-PCR、巢式 PCR、高通量測(cè)序基因芯片、逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增法等。通過(guò)靶向檢測(cè)ORF1-ORF2 連接處的保守基因組區(qū)域,發(fā)現(xiàn)基于實(shí)時(shí)核酸的方法比抗原檢測(cè)分析更靈敏、更具廣泛的反應(yīng)性。普通 RT-PCR 在電泳過(guò)程中易交叉污染。多重 RT-PCR 雖然具有同時(shí)檢測(cè)多種目標(biāo)分子的優(yōu)點(diǎn),但容易發(fā)生非特異性擴(kuò)增。巢式 PCR 無(wú)法對(duì)病毒定量,耗時(shí)長(zhǎng)且容易發(fā)生交叉污染。近年來(lái),普通 RT-PCR、多重 RT-PCR 等逐步被新方法取代。
諾如病毒小分子抑制劑
人類諾如病毒抗病毒藥物早期研究的進(jìn)展緩慢,很大程度上是由于其細(xì)胞培養(yǎng)系統(tǒng)的建立困難。直到2016 年,人類諾如病毒在源自干細(xì)胞的人腸上皮細(xì)胞(human intestinal enteroids, HIEs)中的培養(yǎng)系統(tǒng)才初步建立,但 HIEs 系統(tǒng)中的病毒復(fù)制量?jī)H為670倍,其有限的病毒復(fù)制量仍是研究疫苗和藥物的障礙(諾如病毒在B細(xì)胞系中的復(fù)制量更低)。此外,人類諾如病毒具有物種特異性,無(wú)法感染其他物種。此前對(duì)人類諾如病毒的認(rèn)知主要基于其他杯狀病毒研究,例如通過(guò)鼠諾如病毒在細(xì)胞培養(yǎng)和小鼠模型中篩選潛在抗病毒藥物。在腸道類器官培養(yǎng)模型中篩選諾如病毒抑制劑成為開(kāi)發(fā)慢性感染治療的新策略,許多廣譜抗病毒藥物已在實(shí)驗(yàn)中表現(xiàn)出對(duì)諾如病毒的抑制活性。
1、RNA 聚合酶抑制劑
HuNoV的RNA 依賴的 RNA 聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)在病毒基因組的轉(zhuǎn)錄和復(fù)制中發(fā)揮至關(guān)重要的作用,成為抗病毒治療的重要靶點(diǎn)。RdRp是一種用于病毒復(fù)制的酶,在RNA 病毒中高度保守,且在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中無(wú)同源蛋白,是抗病毒藥物研究的重要靶點(diǎn)。HuNoV 的RdRp 結(jié)構(gòu)類似于其他正鏈 RNA 病毒,具有右手型結(jié)構(gòu),包括手指、手掌和拇指子結(jié)構(gòu)域,以及連接手指和拇指的 N端結(jié)構(gòu)域。手指和拇指子結(jié)構(gòu)域協(xié)作包圍手狀結(jié)構(gòu),形成單鏈模板 RNA 的通道。
①核苷類抑制劑
RNA依賴性RNA 聚合酶(RdRp)是治療諾如病毒感染的重要靶點(diǎn)。核苷類抑制劑(nucleoside inhibitors, NIs)作為底物類似物,通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性抑制終止 RNA 合成,通常表現(xiàn)出廣譜抗病毒活性。目前發(fā)現(xiàn),針對(duì)其他 RNA 病毒開(kāi)發(fā)的核苷抑制劑也可用于諾如病毒感染治療。
法匹拉韋(favipiravir, T-705)是一種前藥,在體內(nèi)快速轉(zhuǎn)化為法匹拉韋三磷酸,通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性抑制病毒復(fù)制轉(zhuǎn)錄并誘發(fā)致命突變。該藥物已在部分國(guó)家廣泛用于流感治療,并在埃博拉病毒、COVID-19及拉沙熱的治療中發(fā)揮作用。法匹拉韋作為嘌呤類似物,可抑制人類諾如病毒復(fù)制子。實(shí)驗(yàn)表明其對(duì)鼠諾如病毒具有療效,在小鼠模型中通過(guò)抗病毒誘變降低病毒載量,并觀察到突變頻率增加及病毒 RNA 傳染性降低。然而,法匹拉韋可能在小鼠和患者體內(nèi)誘導(dǎo)誘變,用于慢性諾如病毒感染存在潛在風(fēng)險(xiǎn)。
利巴韋林(ribavirin)是廣譜抗病毒藥物,對(duì)DNA和RNA病毒均有效,臨床用于呼吸道合胞病毒、流感、拉沙熱、肝炎及麻疹治療。利巴韋林通過(guò)抑制RdRp發(fā)揮作用,對(duì)鼠諾如病毒抑制效果顯著,是當(dāng)前治療諾如病毒感染的主要藥物,尤其在原發(fā)性免疫缺陷患者的慢性感染中療效顯著。但其與硝唑尼特聯(lián)用效果存在爭(zhēng)議,部分臨床數(shù)據(jù)顯示療效欠佳
2′-FdC(2′-fluoro-2′-deoxycytidine)是核苷類似物,其通過(guò)轉(zhuǎn)化為 2′-FdC-三磷酸(FdCTP)并入細(xì)胞 DNA/RNA,抑制病毒復(fù)制,對(duì)HCV、拉沙病毒及克里米亞-剛果出血熱病毒等均有效。研究發(fā)現(xiàn),在RAW264.7小鼠巨噬細(xì)胞模型中,2′-FdC 能有效抑制鼠諾如病毒傳播。能夠顯著降低 RAW264.7 細(xì)胞中 MNV-1 的病毒RNA和NS1/2 蛋白表達(dá)。使用 100 μmol·L-1的 2′-FdC 處理后,諾如病毒滴度降低,其抑制 MNV-1 復(fù)制的 IC50 值為 20.92 μmol·L-1,RAW264.7 細(xì)胞中 2′-FdC 的CC50 值為 1.768 mmol·L-1。為進(jìn)一步驗(yàn)證 2′-FdC 的功效,研究人員測(cè)試了急性清除菌株 MNVCW3 和持續(xù)性菌株 MNVCR6,結(jié)果顯示 2′-FdC 同樣能抑制兩種病毒株的 RNA 復(fù)制及蛋白表達(dá)。
2′-C-甲基胞苷(2′-C-methylcytidine, 2CMC)最初作為抗 HCV 藥物開(kāi)發(fā),但其前藥 Valopicitabine 因胃腸道副作用終止臨床研究。然而,2CMC仍被報(bào)道為潛在抗諾如病毒藥物。研究表明,2CMC 可抑制鼠諾如病毒形成及RNA合成,并在小鼠模型中減少病毒脫落及傳播。在人類諾如病毒 BJAB 細(xì)胞培養(yǎng)系統(tǒng)中,2CMC的EC50值為0.3 μmol·L-1。研究人員評(píng)估了2CMC衍生物,如2FCMC、N-羥基胞苷NHC的活性。在 RAW264.7 細(xì)胞中,2CMC 和2FCMC 的EC50 分別為 6.9 μmol·L-1和 12.7 μmol·L-1,而 NHC 和拉米夫定無(wú)顯著抑制。在 HG23 細(xì)胞中,2CMC、NHC和2FCMC的EC50分別為1.3 μmol·L-1、1.5 μmol·L-1和3.2 μmol·L-1。目前研究聚焦于開(kāi)發(fā)更安全的 2CMC 衍生物。
4-氨基吡咯[2,1-f][1,2,4]三嗪核苷衍生物具有顯著抗諾如病毒活性。其通過(guò)修飾糖基和堿基獲得系列衍生物,其EC50為0.007~11 μmol·L-1,CC50 為0.01~23.7 μmol·L-1。盡管存在細(xì)胞毒性,但其雙重抗小鼠和人類諾如病毒活性為后續(xù)優(yōu)化提供了基礎(chǔ)。
NCT(5-硝基胞苷三磷酸)最初作為抗脊髓灰質(zhì)炎病毒藥物被發(fā)現(xiàn),其抑制 RdRp活性優(yōu)于利巴韋林。過(guò)X射線晶體學(xué)測(cè)定了諾如病毒聚合酶與NCT結(jié)合的高分辨率結(jié)構(gòu)。該結(jié)構(gòu)顯示,RdRp被包裹在一個(gè)包含互補(bǔ)引物模板RNA和兩個(gè)金屬離子的三元復(fù)合物中。NCT分子占據(jù)核苷酸結(jié)合位點(diǎn),通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性抑制導(dǎo)致RNA鏈終止,但其抑制諾瓦克病毒復(fù)制的潛力仍需更多實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。
②非核苷類抑制劑
非核苷類抑制劑(non-nucleoside inhibitors, NNIs)通過(guò)與RdRp變構(gòu)位點(diǎn)結(jié)合,終止復(fù)制所需的構(gòu)象變化。目前NNIs主要針對(duì)HCV或HIV開(kāi)發(fā),尚無(wú)專門針對(duì)人類諾如病毒的上市藥物。
蘇拉明(suramin)通過(guò)脂質(zhì)體遞送可抑制鼠諾如病毒復(fù)制,但其臨床應(yīng)用受限于藥代動(dòng)力學(xué)和毒性問(wèn)題。其衍生物PPNDS最初作為P2X1受體激動(dòng)劑,后證實(shí)對(duì)人諾如病毒和MNV RdRp具有強(qiáng)效抑制。PPNDS通過(guò)結(jié)合RdRp的NAF2位點(diǎn)廣泛抑制轉(zhuǎn)錄活性。在10 μmol·L-1濃度下,PPNDS對(duì)貓諾如病毒聚合酶的IC50達(dá)2.7 μmol·L-1。然而,蘇拉明及PPNDS因細(xì)胞通透性差和非特異性脫靶活性,需進(jìn)一步優(yōu)化以克服研發(fā)障礙。
近年研究發(fā)現(xiàn),HCV NNIs如JTK-109可通過(guò)結(jié)合Thumb I位點(diǎn)(Q414和R419)抑制杯狀病毒科,如諾如病毒屬、沙波病毒屬和拉戈病毒屬等6個(gè)RdRp的轉(zhuǎn)錄活性,其抑制諾如病毒RdRp的IC50為4.3~16.6 μmol·L-1。
NIC02、NIC04、NIC10和NIC12化合物也是潛在的藥物支架。通過(guò)GTP摻入法動(dòng)力學(xué)研究發(fā)現(xiàn),NIC02和NIC04可同時(shí)結(jié)合游離酶及酶-底物復(fù)合物。而NIC10和NIC12只與酶-底物復(fù)合物結(jié)合,因此可能與底物結(jié)合位點(diǎn)不同的變構(gòu)口袋結(jié)合,所以NIC02和NIC04、NIC10和NIC12在諾如病毒RdRp中可能占據(jù)不同的結(jié)合位點(diǎn)。
2、3C樣蛋白酶抑制劑
諾如病毒3C樣蛋白酶(3CLpro)是一種半胱氨酸蛋白酶,其核心結(jié)構(gòu)與胰凝乳蛋白酶類似,由N端反平行β折疊和C端β桶結(jié)構(gòu)域組成?;钚晕稽c(diǎn)位于兩結(jié)構(gòu)域間裂口處,催化三聯(lián)體(Cys139、His30、Glu54)特異性識(shí)別P1 Gln殘基,負(fù)責(zé)病毒多蛋白裂解,生成結(jié)構(gòu)與非結(jié)構(gòu)蛋白。因此,3CLpro是抗諾如病毒藥物設(shè)計(jì)的重要靶點(diǎn)。
蘆平曲韋(rupintrivir)最初針對(duì)人類鼻病毒3CLpro開(kāi)發(fā),近期研究顯示其可抑制人類諾如病毒3CLpro,EC50為(0.3 ± 0.1)μmol·L-1,EC90為(1.5 ± 0.2)μmol·L-1。但A105V和I109V突變可降低病毒對(duì)蘆平曲韋的敏感性,耐藥機(jī)制尚不明確。
GC376 等一系列 3CLpro 過(guò)渡態(tài)抑制劑。過(guò)渡態(tài)類似物競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑在分子結(jié)構(gòu)上與底物相似,在酶促反應(yīng)中,抑制劑和底物競(jìng)爭(zhēng)與酶的活性中心結(jié)合。過(guò)渡態(tài)抑制劑目前可分為兩類,一類是肽基化合物(如 GC376),研究人員利用諾如病毒蛋白酶在谷氨酰胺-甘氨酸肽位點(diǎn)裂解的特點(diǎn),通過(guò)谷氨酰胺替代物發(fā)揮抑制作用?;诖私Y(jié)構(gòu)開(kāi)發(fā)的一系列變體均顯示出高水平抗病毒活性。另一類是大環(huán)化合物,作為肽基抑制劑的結(jié)構(gòu)修飾版本,旨在提高膜透性和口服生物利用度以增強(qiáng)臨床適用性。盡管其效果不及肽基抑制劑,但表現(xiàn)出對(duì) RNA 病毒的廣譜抗病毒活性。
3、未知作用靶點(diǎn)藥物
硝唑尼特(nitazoxanide, NTZ)最初作為抗寄生蟲(chóng)藥物開(kāi)發(fā),后證實(shí)具有廣譜抗病毒活性,臨床用于流感及諾如病毒感染治療。硝唑尼特作為新型藥物的支架參與病毒復(fù)制的宿主調(diào)節(jié)過(guò)程。硝唑尼特生物利用度高且十分安全,具有豐富的上市后經(jīng)驗(yàn),超過(guò)7500萬(wàn)成人和兒童服用過(guò)此藥物。而目前有多項(xiàng)臨床實(shí)驗(yàn)表明,硝唑尼特對(duì)于治療諾如病毒感染具有顯著療效。目前,其新型制劑正在進(jìn)行全球III期臨床試驗(yàn),可抑制輪狀病毒、冠狀病毒、登革熱病毒等多種RNA/DNA病毒。
參考資料
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作者簡(jiǎn)介:小泥沙,食品科技工作者,食品科學(xué)碩士,現(xiàn)就職于國(guó)內(nèi)某大型藥物研發(fā)公司,從事?tīng)I(yíng)養(yǎng)食品的開(kāi)發(fā)與研究。
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